深度水解奶粉只是将蛋白质成分完全水解，即把大分子的蛋白质水解为小分子的氨基酸，对蛋白质过敏的宝宝可以直接吸收这些小分子的氨基酸，从而减轻过敏症状，保证生长发育。 深度水解奶粉的营养元素其实并没有变化，只是改变蛋白分子的结构，让宝宝好吸收，也不会过敏。营养上还是一样的。

 科学家们通过大量研究发现，经过特有的水解技术，把牛奶大分子蛋白质变成短的片段后，可大大降低牛奶的致敏性。产生的水解蛋白具有减少或排除抗原的潜在能力。 水解蛋白是采用酶水解蛋白质变应原，使之分解成小分子或者多肽或者氨基酸。 而其中的脂肪和碳水化合物成分仍与普通配方奶粉相同，营养价值也是相似的，故适用于大多数牛奶蛋白过敏的婴幼儿，能支持婴儿正常的生长发育。

一般水解蛋白奶粉味道都不怎么好，因为水解的原因，所以会有一些苦涩味。 深度水解奶粉又分两类，一种是酪蛋白casein为基础的eHF,一种是以乳清蛋白Whey为基础的eHF。

针对宝宝过敏程度不同，氨基酸配方为植物氨基酸混合配方，不含一点牛奶成分，属无牛奶配方，适于牛奶过敏的诊断和重症的治疗； 深度水解配方为牛奶蛋白经工业化加工后的短肽配方，属牛奶配方。适于牛奶过敏的治疗，但不具诊断价值。 特殊配方奶粉分为： 深度水解蛋白配方奶粉和氨基酸配方奶粉。 这两种特殊奶粉必须要由医生开处方指导购买，要在医生的指导下给宝宝食用。